数据集概述
本数据集围绕真菌病原体Colletotrichum kahawae（Ck）的宿主跳跃与生态物种形成展开，包含病理、分子及地理数据，用于研究Ck从泛性真菌向咖啡浆果病害专性病原体的演化过程，涉及种群遗传、系统发育及物种形成时间估算等内容。
文件详解
- README_for_IMa.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含IMa.zip文件内2个.txt文件的说明，其中Silva2012_IMa.txt为IMa程序输入文件，Silva2012_IMa_nestedmodels.txt为L模式下测试的基因流模型文件，可用于IMa2的-w和-c2参数配置。
- README_for_BEAST_xml.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：推测为BEAST_xml.zip文件的说明文档，可能包含BEAST分析相关的XML文件使用指导。
- BEAST_xml.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包，推测包含BEAST软件分析所需的XML配置文件，用于系统发育及物种分化时间估算。
- IMa.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包，包含IMa程序输入文件及基因流模型测试文件，用于种群遗传结构及基因流分析。
- Silva2012_alignments.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包，推测包含序列比对文件，用于分子系统发育分析。
数据来源
作者Silva, DN（2012年2月2日）
适用场景
- 真菌病原体演化研究：分析Colletotrichum kahawae从泛性真菌向专性病原体的宿主跳跃及物种形成机制。
- 种群遗传学分析：利用IMa输入文件研究Ck的有效种群大小变化及遗传多态性。
- 系统发育时间估算：通过BEAST XML文件估算Ck与近缘谱系的分化时间及种群动态。
- 地理种群结构研究：结合地理数据推断Ck的祖先种群（安哥拉）及衍生种群（东非）的扩散路径。
- 物种形成机制验证：验证宿主特化、无性繁殖在真菌病原体生态物种形成中的作用。
