数据集概述
本数据集围绕开放海洋管水母触手(tentilla)形态演化与捕食特化的关系展开,包含45种管水母的29项触手形态特征测量数据、系统发育树数据及文献中的猎物类型数据,用于分析形态特征与猎物类型的演化关联,探究特化捕食者的演化路径。
文件详解
该数据集包含21个文件,按类型分为以下几类:
- 原始数据文件:
- raw_morphology_data.csv: CSV格式,含触手形态测量数据,字段包括slide_id、Species、Specimen及29项形态特征(如Heteroneme free length、Heteroneme width等)
- raw_categorical_data.csv: CSV格式,含分类变量数据
- slide_metadata.csv: CSV格式,含样本成像元数据,字段包括Slide、Species、Specimen、Bin、Treatment、成像方式(Confocal、DIC等)
- literature_diet_data.tsv: TSV格式,含文献中的猎物类型数据
- Purcell1984_preylength.csv、Purcell1981_selectivity.csv: CSV格式,引用文献中的猎物长度及选择性数据
- PGLS_SIGN_preylength.csv: CSV格式,含系统发育广义最小二乘法分析的猎物长度数据
- 系统发育数据文件:
- 18S_alignment.nexus、16S_alignment.nexus、concatenate_18S16S_alignment.nexus: NEXUS格式,含18S、16S核糖体RNA序列比对数据
- 分析结果与文档文件:
- species_mean_data.pdf、RevBayestrees.pdf、accession_numbers.pdf: PDF格式,含物种均值数据、系统发育树及基因登录号
- 8个PDF文件: 包含各类分析结果与文档
- 代码文件:
- R_Code.R: R语言格式,含数据分析代码
适用场景
- 海洋生物学研究: 分析管水母触手形态演化与捕食策略的关系
- 系统发育学研究: 探究形态特征在系统发育树上的演化模式
- 捕食生态研究: 研究猎物类型与捕食者形态特化的关联机制
- 进化生物学研究: 验证特化捕食者的演化路径是否为“死胡同”假说
- 生物多样性研究: 分析管水母捕食生态位分化的形态学基础