数据集概述
该数据集为抗回旋病甘尼森河虹鳟的基因组与转录组分析补充数据,包含29个文件,涉及遗传变异检测参数、基因特征读数分配、染色体选择信号等核心内容,支持相关生物学机制研究。
文件详解
数据集包含两类文件,具体说明如下:
- 数据文件(.xlsx格式,共20个):
- Supplementary Table 1. Description of parameters used to detect genetic variation and signature selection..xlsx:遗传变异及选择信号检测参数说明
- Supplementary Table 3. Trimmed Reads..xlsx:修剪后读数数据
- Supplementary Table 8 A,B,C. Significant windows of detected by the three approches..xlsx:三种方法检测的显著窗口数据
- Supplementary Table 16. Reads assigned to gene features by featureCounts ..xlsx:featureCounts分配至基因特征的读数数据
- Supplementary Table 9 A,B,C. Normalized densities of significant windows under selection for each chromosome detected by the three approaches..xlsx:各染色体选择下显著窗口的标准化密度数据
- Supplementary Table 5. Read Mapping data of Gunnison River Rainbow trout to the reference genome at different time points.xlsx:不同时间点甘尼森河虹鳟至参考基因组的读数比对数据
- Supplementary Table 15. List of all genes shared between the three methods..xlsx:三种方法共有的基因列表
- 栅格文件(.tiff格式,共9个):
- 包含Supplementary Fig 1..tiff至Supplementary Fig 5..tiff等图片文件,为分析结果的可视化图表
适用场景
- 鱼类抗病分子机制研究:分析虹鳟抗回旋病的基因组与转录组特征
- 遗传变异检测方法验证:基于多方法检测的显著窗口数据优化分析流程
- 基因表达调控分析:利用基因特征读数分配数据探究抗病相关基因表达模式
- 进化生物学研究:通过染色体选择信号数据研究虹鳟抗病性状的进化机制