数据集概述
本数据集为卡彭氏索足蛤在氧波动条件下差异表达基因的功能注释数据，是研究论文的补充数据文件，包含基因组装信息、测序元数据、注释摘要、表达量数据及功能富集结果等，支持对该物种氧适应分子机制的分析。
文件详解
- 文件名称：Lucinoma.Suppl.readme.docx，格式：docx，内容：数据集说明文档，提供文件结构及使用指引
- 文件名称：Lucinoma.Suppl.AssemblyINFO.zip，格式：zip，内容：基因组装相关信息的压缩文件
- 文件名称：Lucinoma.Suppl.SRA_metadata.xls，格式：xls，内容：测序数据存档（SRA）的元数据表格
- 文件名称：Lucinoma.Suppl.Annotation_Summary.xls，格式：xls，内容：基因功能注释结果的汇总表格
- 文件名称：Lucinoma.Suppl.readcount_genename.xls，格式：xls，内容：基因名称对应的原始读段计数数据
- 文件名称：Lucinoma.Suppl.fpkm_genename.xls，格式：xls，内容：基因名称对应的FPKM标准化表达量数据
- 文件名称：Lucinoma.Suppl.QC_summary_DEG_annotation.xlsx，格式：xlsx，内容：差异表达基因（DEG）注释的质量控制汇总
- 文件名称：Lucinoma.Suppl.BUSCO_summary.xls，格式：xls，内容：基因集完整性评估（BUSCO）结果汇总
- 文件名称：Lucinoma.Suppl.Unigene.fasta，格式：fasta，内容：拼接得到的单基因序列文件
- 文件名称：Lucinoma.Suppl.Reactome-annotations-of-unigenes.xlsx，格式：xlsx，内容：单基因的Reactome通路注释结果
数据来源
Zenodo
适用场景
- 海洋生物学研究：分析卡彭氏索足蛤在氧波动环境中的基因表达调控机制
- 分子生态学研究：探究底栖生物对低氧胁迫的适应性进化
- 功能基因组学分析：开展差异表达基因的功能富集及通路注释研究
- 生物信息学方法验证：验证转录组数据分析流程在双壳类物种中的适用性
