数据集概述
本数据集围绕肯尼亚植物区系生物多样性热点形成机制研究,包含被子植物系统发育树、物种分布记录、基因序列 accession 号及样本信息等核心数据,支撑分析气候波动与造山运动对肯尼亚植物区系系统发育β多样性格局的影响,识别五大植物地理分区。
文件详解
- README.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含数据集标题、作者信息(姓名、ORCID、机构、联系方式)等元数据
- 2_Samples_with_accession_numbers_dowbloaded_from_GenBank.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含Organism(物种名)、atpB、matK、ndhF、rbcL(基因序列accession号)字段
- 1_Accession_numbers_for_Newly_generated_sequence.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含Organism(物种名)、atpB、matK、ndhF、rbcL(新生成序列的accession号)字段
- 6_Species_tree_producted_by_v.phylomaker.tre
- 文件格式:TRE
- 字段映射介绍:通过v.phylomaker生成的物种系统发育树文件
- 3_species_distribution_records_in_county_level.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含县级尺度的物种分布记录相关字段
- 4_species_habitat.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:物种栖息地信息文档
- 5_Time_Tree_as_backbone_procucted_by_treePL.tre
- 文件格式:TRE
- 字段映射介绍:通过treePL生成的时间树(作为系统发育分析的骨干树)
数据来源
论文“New insights into the formation of biodiversity hotspots of the Kenyan flora”
适用场景
- 植物区系生物多样性机制研究: 分析气候波动与造山运动对肯尼亚植物区系系统发育β多样性格局的影响
- 植物地理分区识别: 支撑肯尼亚五大植物地理分区(Mandera、Turkana、Volcanic、Pan Coastal、West Highland)的验证与细化
- 系统发育分析: 利用物种树与时间树数据开展被子植物系统发育关系研究
- 物种分布格局分析: 基于县级尺度分布记录探索肯尼亚植物物种分布规律
- 基因序列关联研究: 结合GenBank下载及新生成的基因序列accession号,开展植物分子系统学分析