数据集概述
本数据集为“知识引导多层网络代谢物注释”研究的补充数据,包含9个文件,涵盖代谢物注释工具对比评估、标准混合物验证、不同生物样本分析结果及知识库挖掘等内容,支持从已知到未知代谢物的注释研究,主要文件格式为XLSX和ZIP。
文件详解
- Supplementary data 1.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:MetDNA1与KGMN(MetDNA2)的峰注释评估数据
- Supplementary data 2.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:46种标准混合物(46std_mix)及基于知识的代谢反应网络数据
- Supplementary data 3.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:46std_mix数据集的KGMN分析结果与验证结果
- Supplementary data 4.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:NIST尿液数据集的KGMN分析结果与验证结果
- Supplementary data 5.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:不同生物样本的KGMN分析结果
- Supplementary Data 6.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:通过知识库挖掘得到的NIST尿液中反复出现的未知代谢物数据
- Supplementary data7.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:KGMN中使用的加合物、中性丢失及经验规则表
- Supplementary data 8.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:未明确具体内容的压缩文件
- Supplementary data 9.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:未明确具体内容的压缩文件
适用场景
- 代谢物注释工具性能评估: 对比MetDNA1与KGMN的峰注释效果,优化代谢组学分析流程
- 标准代谢物验证研究: 基于46种标准混合物数据,验证KGMN的注释准确性
- 生物样本代谢组学分析: 利用不同生物样本的KGMN结果,开展代谢组学差异研究
- 未知代谢物挖掘: 通过知识库挖掘方法,识别生物样本中反复出现的未知代谢物
- 代谢反应网络构建: 基于标准混合物数据,完善知识引导的代谢反应网络模型