数据集概述
本数据集为巴基斯坦两个山羊品种毛色模式的基因组分析研究数据，通过GoatSNP50芯片对35只具花斑（roan）毛色的山羊（A组）与740只无该毛色的山羊（B组）进行基因分型，结合纯合子运行（ROH）和XP-EHH分析，识别出3个潜在关联基因组区域，其中5号染色体上含KITLG基因的区域差异最显著，支持该基因与山羊花斑毛色相关的假设。
文件详解
- README_for_TalentiEtAl_2017.txt
- 文件格式：TXT
- 内容介绍：提供数据集说明文档，包含基因型数据文件的编码规则，如FID列（品种编码，Beetal Muki Cheni和Barri品种为文本编码，其余为数字编码）、IID列（个体ID）及表型数据说明。
- TalentiEtAl_2017.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容介绍：压缩包文件，推测包含论文提及的929只动物的非相位基因型数据文件（如TalentiEtAl_2017.ped），记录样本的基因型信息。
数据来源
论文“Genomic analysis suggests KITLG is responsible for a roan pattern in two Pakistani goat breeds”
适用场景
- 山羊毛色遗传机制研究：分析KITLG基因与花斑毛色表型的关联，探索分子遗传机制。
- 基因组选择标记开发：基于关联区域开发山羊毛色性状的分子标记，用于品种选育。
- 比较基因组学分析：对比不同品种山羊基因组差异区域，研究毛色相关基因的进化保守性。
- 动物遗传学教学案例：作为基因组关联分析（GWAS）方法应用的实例数据，用于教学或方法验证。
