数据集概述
本数据集为kmhernan/test-wf-yevis中的工作流数据,包含Common Workflow Language(CWL)定义文件及相关配置、元数据文件,由Pitagora Network维护,用于生物信息学工具与工作流的标准化定义与共享,共包含4个文件。
文件详解
- 文件名称:yevis-metadata-1.0.0.yml
- 文件格式:YML
- 字段映射介绍:工作流元数据文件,具体字段未详细说明。
- 文件名称:README.md
- 文件格式:MD
- 字段映射介绍:包含Pitagora Workflows in CWL的项目说明、工具列表(如download-sra、fastq-dump等)及维护机构信息。
- 文件名称:download-sra.cwl
- 文件格式:CWL
- 字段映射介绍:Common Workflow Language格式的工具定义文件,对应“Get Data”类工具中的download-sra工具。
- 文件名称:wf_params.json
- 文件格式:JSON
- 字段映射介绍:工作流参数配置文件,具体字段未详细说明。
数据来源
kmhernan/test-wf-yevis仓库
适用场景
- 生物信息学工作流标准化:用于生物信息学工具与工作流的CWL格式定义与共享。
- 工作流复用与集成:支持不同生物信息学平台间的工作流复用与集成。
- 生物信息学工具管理:辅助Pitagora Network维护和管理生物信息学工具库。
- 科研协作支持:为Galaxy Community Japan等社区的科研协作提供标准化工作流定义资源。