数据集概述
本数据集为空间干细胞命运工程研究的处理数据,围绕简易形态发生素定位展开,包含荧光强度剖面、多谱系分化等相关的图像与分析文件,支持干细胞命运调控机制的研究。
文件详解
数据集包含多类处理后文件,按研究场景分类如下:
- 心肌细胞边缘分析文件(CM edge cTnT Sox2目录):
- 图像文件:如Heart edge 10X_RGB_C1.tif、cTnT Sox2.jpg等,含RGB多通道图像与灰度图像
- 16位图像子目录:存储16位深度的高分辨率图像文件(TIFF格式)
- 上皮细胞模式化文件(Epi patterning目录):
- 图像文件:如Droplet (wnt3a + BMP4) edge 10X_RGB_C3.tif等,记录Wnt3a与BMP4组合处理的液滴边缘图像
- 16位图像子目录:存储对应高分辨率图像
- JPG子目录:包含cTnT WT1.jpg等结果展示图
- 分析文件:如111120 FL intensity profile (cTnT, WT1 expression).opj(OriginPro分析项目)、.xlsx(Excel数据表格)
- 多谱系分化文件(Multi-lineage目录):
- BMP4处理组:含D3/D5/D7不同时间点的TIFF图像(如D5 (5).tif)、JPG结果图(如D5 488 Sox17.jpg)及16位图像子目录
- Activin A处理组:含不同时间点的RGB多通道TIFF图像、OriginPro分析项目文件(.opj)、Excel数据表格(.xlsx),并设有TIFF子目录存储原始图像
- 肌节分析文件(Sacomere analysis目录):
- 分析子目录:含BlindRandomFiles2020_09_21_T_17_31_09_516等盲法分析文件
适用场景
- 干细胞生物学研究:分析形态发生素定位对干细胞命运的调控机制
- 组织工程研究:探究空间因素对心肌细胞、上皮细胞等分化的影响
- 图像分析方法开发:基于多通道荧光图像优化干细胞分化图像的量化分析算法
- 再生医学研究:为干细胞定向分化的空间调控策略提供数据支持