数据集概述
本数据集围绕生物地理学领域，以西方栅栏蜥蜴为模型物种，整合景观遗传学与系统地理学方法，研究不同空间尺度下的种群遗传推断及进化尺度上的种群结构，分析两者在遗传变异时空结构研究中的关联与一致性。
文件详解
该数据集包含50个文件，覆盖多种数据类型，具体说明如下：
- 文档与说明文件:
- README.md: 数据集说明文档，格式为Markdown，介绍研究背景与数据概况
- phylo-95-varsites.phy_modeltest.txt: 系统发育模型测试结果文件，格式为TXT
- STACKS_pipeline.txt: 基因序列分析流程文件，格式为TXT
- ipyrad_parameters.txt: 序列组装参数文件，格式为TXT
- 系统发育分析文件:
- phylo-95-varsites.nex: 系统发育分析输入文件，格式为NEX
- phylo-95-varsites.phy.log: 系统发育分析日志文件，格式为LOG
- 系统发育输出文件（如phylo-95-varsites.phy.nex.con.tre、phylo-95-varsites.phy.nex.mcmc等）: 包含进化树、MCMC分析结果等，格式为NEX相关衍生格式
- 空间数据文件:
- 栅格数据文件（如Yosemite-1225_cum_curmap.asc、Yosemite_2500_Comp3.asc等）: 共20个，格式为ASC，存储地理空间分布数据
- 位置数据文件（如Yosemite_2500_locations.csv）: 格式为CSV，包含样本地理坐标信息（X、Y字段）
- 遗传数据文件:
- 遗传数据文件（如Yosemite_1225_genetic.csv）: 格式为CSV，包含种群遗传变异数据，字段为样本编号
- 图像文件:
- rivers_labels.png、rivers_nolabels.png: 河流分布地图文件，格式为PNG
适用场景
- 生物地理学研究: 分析景观遗传学与系统地理学方法的关联性与一致性
- 种群遗传学分析: 探究不同空间尺度下的种群遗传结构变化
- 进化生物学研究: 解析物种在不同进化尺度上的谱系地理格局
- 空间生态学研究: 验证地形水文特征对种群基因流动的影响机制
- 生物信息学方法学: 测试多尺度生物地理推断模型的有效性
