口腔鳞状细胞癌肿瘤内细菌与新辅助PD_1阻断疗法反应关联数据集

数据集概述

该数据集围绕口腔鳞状细胞癌患者肿瘤内细菌与新辅助PD-1阻断疗法反应的关联展开，包含基于INVADEseq技术的微生物组研究相关分析代码，支持探究肿瘤内细菌对免疫活性及治疗效果的影响。

文件详解

• 代码文件（共7个，均为R格式）：
• 2bRAD分析.R：用于2bRAD测序数据的分析
• 16S分析.R：用于16S rRNA基因测序数据的分析
• CNV分析.R：用于拷贝数变异（CNV）数据的分析
• MPR分组T细胞亚型注释.R：用于基于主要病理缓解（MPR）分组的T细胞亚型注释
• 空转数据分析.R：用于空间转录组数据的分析
• 细胞通讯分析.R：用于细胞间通讯数据的分析
• 预后数据分析.R：用于预后相关数据的分析

适用场景

• 肿瘤免疫学研究：分析肿瘤内细菌对CD8+ T细胞与cDC1相互作用的影响
• 免疫治疗疗效预测：探究肿瘤内细菌作为新辅助PD-1阻断疗法反应预测因子的潜力
• 口腔鳞状细胞癌研究：研究口腔癌肿瘤微环境中微生物组与免疫应答的关联
• 生物信息学方法应用：验证INVADEseq技术在肿瘤微生物组研究中的分析流程