数据集概述
本数据集为论文“Quantitative global studies reveal differential translational control by start codon context across the fungal kingdom”的补充数据，包含四章研究内容的相关表格文件。研究涉及真菌界翻译起始密码子上下文调控、隐球菌转座子沉默机制、不同酵母物种剪接体功能及剪接体蛋白保守性分析等主题，提供基因表达、蛋白组学、测序数据等结构化补充信息，总计29个文件。
文件详解
- 主要文件类型及内容
- Excel文件（.xlsx）：共25个，包括测序数据统计（如Chapter_1_Table_S1_sequencing_numbers.xlsx）、翻译起始因子数据（如Chapter_1_Table_S7_eIF3.xlsx）、蛋白组学分析结果（如Chapter_4_Supp_Table_7_Proteomes-2.xlsx）、tRNA合成酶数据（如Chapter_1_Table_S5_tRNAsynthetases6fungi.xlsx）等。
- 文本文件（.txt）：共3个，包含基因列表及差异分析数据（如Chapter_1_Table_S4_dvsaATG_highdiffw_enoughRNA_H99.txt记录d1AUG与aAUG得分差异>0.1的基因）、双AUG上下文分析数据（如Chapter_1_Table_S6_dualAUG_aaRS_contexts_cc.txt）等。
- CSV文件（.csv）：1个（Chapter_2_Table_S1.csv），包含基因注释及测序reads数据，字段包括Gene、Hiten's Annotation、CH Annotation、Wild Reads、KO Reads、log2 ratio、Z值等。
数据来源
论文“Quantitative global studies reveal differential translational control by start codon context across the fungal kingdom”
适用场景
- 真菌翻译调控机制研究：分析起始密码子上下文对翻译起始的影响及跨物种差异。
- 转座子沉默机制研究：探究隐球菌中转座子抑制相关基因及endo-siRNAs的作用机制。
- 剪接体功能与进化分析：研究不同真菌物种剪接体结构、功能及保守蛋白的作用。
- 基因表达与蛋白组学分析：利用测序数据、蛋白组数据开展真菌基因表达调控及蛋白定位研究。
- 分子生物学实验设计：为真菌翻译起始、RNA干扰、剪接体相关实验提供数据参考。
