数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)KS99菌株(携带egl-27(ok151)基因突变)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成虫在含OP50食物的NGM培养基上的运动行为,包含视频追踪原始数据、特征提取结果及运动坐标数据,支持基因功能与行为表型关联研究。
文件详解
- 文件1:
egl-27 (ok151)II on food R_2010_09_24__12_58_08__6.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含秀丽隐杆线虫运动行为的wcon格式数据压缩包,记录线虫运动的坐标、时间序列等原始追踪信息
- 文件2:
egl-27 (ok151)II on food R_2010_09_24__12_58_08__6_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:使用tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含运动速度、弯曲度、身体姿态等结构化特征指标
- 文件3:
egl-27 (ok151)II on food R_2010_09_24__12_58_08__6.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:线虫行为实验的核心数据文件,包含26967个分割骨架数据、时间戳、像素-微米转换系数(4.56732)等基础实验参数
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析egl-27(ok151)基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 行为表型组学分析: 基于运动特征数据开展线虫行为表型的定量分析与模式识别
- 基因-行为关联研究: 探索egl-27基因在调控线虫运动行为中的作用机制
- 线虫行为实验方法验证: 参考实验方案(E. Yemini等方法)优化线虫行为学实验设计
- 模式生物行为数据库补充: 为秀丽隐杆线虫行为数据库提供标准化的基因突变体行为数据