昆虫DNMT和TET同源物识别的Profile隐马尔可夫模型数据集

数据集概述

本数据集包含基于节肢动物DNMT和TET序列构建的Profile隐马尔可夫模型（HMM），用于识别昆虫中的DNMT和TET同源物。模型覆盖DNMT1、TRDMT1、DNMT3和TET四种甲基化相关酶，为昆虫表观遗传学研究提供工具支持。

文件详解

• 文件名称及格式：数据集包含4个HMM格式文件，分别对应不同酶类型：
• 1.DNMT1.hmm：DNA甲基转移酶1的Profile HMM模型
• 2.TRDMT1.hmm：tRNA天冬氨酸甲基转移酶2（又称DNMT2）的Profile HMM模型
• 3.DNMT3.hmm：DNA甲基转移酶3的Profile HMM模型
• 4.TET.hmm：Ten-eleven易位甲基胞嘧啶双加氧酶的Profile HMM模型
• 文件类型：所有文件均为.hmm格式，占比百分之百

数据来源

OrthoDB（http://www.orthodb.org/）

适用场景

• 昆虫表观遗传学研究：识别昆虫基因组中的DNMT和TET同源基因
• 比较基因组学分析：探究节肢动物甲基化酶家族的进化关系
• 功能基因组学：预测昆虫甲基化相关酶的潜在功能
• 分子生物学实验：为引物设计或蛋白结构分析提供靶点参考