数据集概述
本数据集包含论文《Amplification editing enables efficient and precise duplication of DNA from short sequence to megabase and chromosomal scale》中所有图表对应的原始实验数据,涵盖FISH、核型分析、凝胶电泳、Southern blot及流式细胞术等多类型实验结果文件。
文件详解
该数据集按实验类型和对应图表分类存储,具体说明如下:
- FISH与核型分析图片(对应Figure 6、S6):
- 目录:The FISH and Karyotype pictures, related to Figure 6, S6/
- 文件格式:.tif、.jpg
- 示例文件:Chr 6 Edit-1-CSP6.tif、Karyotype of Chr 6-dup 100 Mb.jpg
- 凝胶电泳与Southern blot图片(对应Figure 1、3、5、S2-3、S5):
- 目录:The gel pictures and southern blot pictures related to Figure 1, 3, 5, S2-3, S5/
- 子目录:single-cell clones/(包含单克隆实验结果)
- 文件格式:.scn、.png
- 示例文件:Fig 1C.scn、Fig 3I RUNX1-dup 1132 bp southern blot.png
- 流式细胞术分析数据(对应Figure 4、7、S8):
- 目录:The flow cytometry analysis, related to Figure 4, 7, S8./
- 子目录:Fig 4 disGFP recovery/、Fig 7 haESCs hapolid /、Fig S8 EdU incorporation assay /
- 文件格式:.fcs(流式细胞术标准格式)
- 示例文件:Fig_4B_AE_1.fcs、Haploid Chr 11-1.3 Mb.fcs、Aphidicolin-12h-1.fcs
适用场景
- 分子生物学研究:验证扩增编辑技术在DNA复制中的效率与精准度
- 基因组工程应用:分析不同长度DNA序列(短序列至染色体级)的编辑效果
- 实验方法学参考:复现FISH、Southern blot及流式细胞术等实验的原始数据处理流程
- 生物技术转化:评估扩增编辑技术在基因治疗、合成生物学等领域的应用潜力