数据集概述
本数据集包含用于扩展与波动增强显微镜(eSRRF)参数优化的数据处理手册及测试样本,涵盖微管、肾脏活检、单发射器模拟等5类样本图像,配套Jupyter笔记本支持定量图像分析,为eSRRF图像处理参数优化提供实践支持。
文件详解
- 文档文件:
- eSRRF_Data processing manual.pdf(PDF格式):eSRRF参数优化培训手册,含ImageJ插件与Python实现的操作指南、测试样本处理流程及预期结果说明
- 测试图像文件(TIFF格式):
- Set01_DNA-PAINT_Microtubules.tif:固定COS-7细胞微管的DNA-PAINT图像,108×90像素、500帧、像素尺寸160nm
- Set02_KidneySDNephrinExM.tif:人肾脏活检样本的扩展显微镜图像,150×150像素、200帧、像素尺寸102nm
- Set03_simulation_groundTruth_2p5Sigma - Fluorescence stack_Avg5.tif:单发射器模拟图像,33×33像素、100帧、像素尺寸100nm
- Set04_ExSRRF_eSRRF_vibration_correction_practice_dataset.tif:肾脏样本振动校正测试图像,100×100像素、200帧、像素尺寸102nm
- Set05_Photobleaching.tif:120nm纳米标尺的光漂白测试图像,150×150像素、75帧、像素尺寸64nm
- 代码文件:
- ridge_detection.ipynb(Jupyter笔记本格式):支持ExSRRF解析结构的定量分析,含密度计算、脊间距映射、空间均匀性评估功能
适用场景
- 超分辨显微镜图像处理:eSRRF参数优化方法的实践与验证
- 生物医学图像分析:细胞微管、肾脏组织等生物样本的纳米级结构定量研究
- 图像处理算法开发:显微镜图像漂移校正、光漂白分析的算法测试
- 科研培训:超分辨显微镜数据处理流程的教学实践