数据集概述
本数据集包含爱琴海绿蜥蜴（Lacerta trilineata–pamphylica群）辐射演化研究的基因组标记数据，用于检验爱琴海生物地理分化模型（隔离分化、陆地扩散、岛屿踏脚石扩散），分析种群结构、祖先分布区及演化时间线，共包含4个文件。
文件详解
- Lacerta_uSNPs_STRUCTURE.ustr
- 文件格式：ustr
- 字段映射介绍：用于种群结构分析的单核苷酸多态性（uSNPs）数据，适配STRUCTURE软件输入格式
- Lacerta_uSNPs_SVD.phy
- 文件格式：phy
- 字段映射介绍：用于奇异值分解（SVD）分析的单核苷酸多态性（uSNPs）数据，采用PHYLIP格式存储
- Lacerta_Concat_ML.phy
- 文件格式：phy
- 字段映射介绍：用于最大似然（ML）树构建的串联基因组位点数据，采用PHYLIP格式存储
- Lacerta_biallelic_uSNPs_SNAPP.xml
- 文件格式：xml
- 字段映射介绍：用于SNAPP软件分析的双等位基因单核苷酸多态性（uSNPs）数据，包含XML格式的元数据与位点信息
数据来源
论文“Genome-wide markers untangle the green-lizard radiation in the Aegean Sea and support a rare biogeographical pattern”
适用场景
- 生物地理学模型验证: 检验爱琴海绿蜥蜴的隔离分化、陆地扩散及岛屿踏脚石扩散模型
- 种群基因组结构分析: 基于uSNPs数据探究绿蜥蜴种群的遗传结构与分化水平
- 演化时间线推断: 结合线粒体DNA与核基因数据构建时间校准的系统发育树
- 祖先分布区重建: 分析爱琴海绿蜥蜴的祖先分布区域及扩散路径
- 地中海生物多样性研究: 以绿蜥蜴为案例，探讨爱琴海地理屏障对东地中海类群演化的影响
