数据集概述
本数据集记录了通过实验室哺乳动物模型(银行田鼠)研究捕食行为选择的基因组响应。经13代选择后,所选品系捕食行为比例为对照品系的5倍。分析了海马体和肝脏转录组,发现等位基因频率和基因表达存在可重复变化,涉及饥饿、攻击性等相关基因,并与有氧能力进化进行比较,揭示不同数量性状选择的分子模式差异。
文件详解
- 压缩文件
- 文件名称:scripts.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含用于数据分析的脚本文件
- 文件名称:allele_frequencies.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含等位基因频率相关数据
- 文件名称:transcriptome_and_annotation.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含转录组数据及注释信息
- 文件名称:expression.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含基因表达相关数据
- 文件名称:Fst_tabels.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含Fst分析相关表格数据
数据来源
标题:Data from: Genomic response to selection for predatory behavior in a mammalian model of adaptive radiation
适用场景
- 捕食行为遗传机制研究: 分析捕食行为相关基因的等位基因频率和表达变化
- 适应性进化分子模式分析: 比较捕食行为与有氧能力选择的分子响应差异
- 数量性状选择响应研究: 探讨不同数量性状选择下的基因组响应规律
- 行为遗传学研究: 探究饥饿、攻击性等行为相关基因的功能及调控机制