数据集概述
本数据集为蓝面镖鲈(Etheostoma cyanoprosopum)遗传结构与多样性研究的配套数据,包含样本信息、基因序列比对及微卫星DNA数据三类文件。蓝面镖鲈是美国东南部Mobile盆地的微特有淡水鱼类,分布范围小于20公里,面临栖息地退化和种群连通性破碎化威胁。数据用于评估其种群遗传连通性、多样性,并与近缘种斑鳍镖鲈(E. zonistium)比较,为保护决策提供依据。
文件详解
- 样本信息文件
- 文件名称:Blueface_Bandfin_specimen_info.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录蓝面镖鲈与斑鳍镖鲈的样本基础信息,可能包含样本编号、采集地点、种群归属等用于遗传分析的样本元数据。
- 线粒体DNA序列比对文件
- 文件名称:Blueface_cytb_alignment.fst
- 文件格式:FST
- 字段映射介绍:包含蓝面镖鲈细胞色素b(cytb)基因的序列比对数据,用于分析种群间的历史遗传结构。
- 微卫星DNA数据文件
- 文件名称:Blueface_Bandfin_GENEPOP.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:标题为“Blueface and Bandfin Darter microsatellite DNA data”,包含微卫星位点(如Esc132b、Esc68等)的基因型数据,用于评估当代种群遗传结构与连通性。
数据来源
论文“Genetic structure and diversity of the blueface darter Etheostoma cyanoprosopum, a microendemic freshwater fish in the southeastern United States”
适用场景
- 淡水鱼类遗传多样性评估: 分析蓝面镖鲈种群的遗传多样性水平,为濒危物种保护优先级划分提供依据。
- 种群连通性研究: 利用微卫星数据探究地理隔离(如流域分隔、水库建设)对蓝面镖鲈种群基因交流的影响。
- 物种保护策略制定: 基于遗传结构分析结果,制定针对蓝面镖鲈的栖息地连通性恢复、种群监测等保护措施。
- 近缘物种比较研究: 通过与斑鳍镖鲈的遗传数据对比,揭示微特有物种与广布物种的遗传分化机制。
- 濒危物种遗传学参考: 为其他微特有淡水鱼类的遗传多样性研究提供方法与数据参考框架。