数据集概述
本数据集包含用于验证局部时钟置换测试（LCPT）的模拟文件及说明文档，LCPT是一种用于比较系统发育树分支间分子进化速率等参数差异的统计测试方法。数据集旨在支持相关研究中对分子进化速率差异的显著性检验，替代传统似然比检验（LRT）在多数场景下的统计有效性问题。
文件详解
- README_for_LCPT_simulation_files.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含LCPT模拟文件的使用说明，提及配套Python脚本可执行论文中的模拟和分析，要求引用相关论文，并说明脚本依赖情况。
- LCPT_simulation_files.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包内包含执行LCPT模拟所需的相关文件及可执行程序，具体内容需解压后查看。
数据来源
论文“The local-clock permutation test: a simple test to compare rates of molecular evolution on phylogenetic trees”（doi: 10.1111/j.1558-5646.2010.01160.x）
适用场景
- 分子进化速率差异检验: 用于测试系统发育树分支间分子进化速率的显著性差异。
- 系统发育树参数分析: 支持对系统发育树分支上任意可分配参数的差异检验。
- 统计测试方法验证: 验证LCPT相比传统LRT在分子进化速率比较中的有效性和检验效能。
- 分子进化研究工具开发: 为相关领域研究人员提供模拟数据及脚本，支持分子进化速率比较工具的开发与优化。
