Lep_Anchor_Based_刺鱼参考基因组组装优化数据

数据集概述

本数据集记录了使用Lep-Anchor软件整合密集连锁图谱、重叠检测和长读长桥接技术,优化九刺和三刺刺鱼参考基因组组装的过程与结果。通过去除单倍型contig、提升基因组连续性(尤其是X染色体)及检测遗传变异,展示了非模式生物基因组组装优化的方法与效果。

文件详解

  • 文件名称:NSP_V7.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:压缩包内包含与Lep-Anchor软件优化刺鱼参考基因组组装相关的数据,具体字段需解压后查看,推测包含基因组contig序列、组装统计数据、变异检测结果等与基因组组装优化相关的核心信息。

数据来源

论文“Automated improvement of stickleback reference genome assemblies with Lep-Anchor software”

适用场景

  • 基因组组装优化研究:分析Lep-Anchor软件在提升刺鱼基因组连续性、单倍型准确性中的应用效果。
  • 鱼类基因组学研究:为九刺、三刺刺鱼的基因功能、进化分析提供高质量参考基因组数据支撑。
  • 生物信息学方法验证:验证整合连锁图谱、长读长技术优化基因组组装的技术路线可行性。
  • 非模式生物基因组研究:为非模式生物参考基因组的组装优化提供方法学参考案例。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 118.27 MiB
最后更新 2026年1月29日
创建于 2026年1月29日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。