数据集概述
本数据集为研究鳞龙类(蜥蜴、蛇、喙头蜥)起源的整合数据,包含德国Vellberg地区中三叠世最古老鳞龙类化石相关的分子序列、系统发育矩阵及分析文件,用于结合化石与分子证据确定鳞龙类起源时间,共5个文件。
文件详解
- 系统发育矩阵文件
- 文件名称:Vellberg_FossilPhylo_matrixPAUPmrB.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:包含用于PAUP分析的化石与现生类群系统发育矩阵数据
- 分子序列文件
- 文件名称:RAG1_121006_mb.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:77个现生类群的RAG1基因序列数据,用于分子钟分析
- 分析输入文件
- 文件名称:Vellberg_PLr8s_phylo4BEAST_INfile.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:r8s和BEAST分析的输入文件,含NEXUS格式标记及研究相关元数据
- BEAST配置文件
- 文件名称:Sphenodon_mean4_238.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:BEAST分析的参数配置文件,包含化石校准点等设置
- 系统发育树文件
- 文件名称:Vellberg_BEAST_MaxCladeCred_NEWICK.trees
- 文件格式:TREES
- 字段映射介绍:BEAST分析得到的最大分支可信度系统发育树,以NEWICK格式存储
数据来源
论文“Integration of molecules and new fossils supports a Triassic origin for Lepidosauria (lizards, snakes, and tuatara)”
适用场景
- 鳞龙类起源时间研究: 结合化石与分子数据,分析鳞龙类及有鳞目冠群的起源时间
- 古生物系统发育分析: 利用系统发育矩阵和分子序列数据构建鳞龙类演化树
- 分子钟校准验证: 通过化石校准点验证分子钟估算的生物演化时间尺度
- 三叠纪生物复苏研究: 探讨鳞龙类起源与二叠纪末大灭绝后生物复苏的关系
- 脊椎动物化石记录补全: 基于Vellberg化石 locality数据,研究三叠纪脊椎动物群组成