数据集概述
本数据集基于红胸太阳鱼(Lepomis auritus)的ddRAD基因数据,通过系统发育基因组分析重建其入侵路线,明确非本地种群的来源,包括德克萨斯州、田纳西河上游等区域的入侵来源,为该物种的入侵管理及本土生物多样性保护提供关键信息。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称:README.md
- 文件格式:MD
- 字段映射介绍:数据集说明文档,包含数据文件的描述信息
- 系统发育分析文件
- 文件名称:SNAPP_divergence_time.xml、SNAPP_divergence_time.nex、SNAPP_divergence_time.tre
- 文件格式:XML、NEX、TRE
- 字段映射介绍:SNAPP分歧时间分析的输入文件、数据集文件及时间校准的物种树结果文件
- 群体结构分析文件
- 文件名称:SNMF.ugeno
- 文件格式:UGENO
- 字段映射介绍:SNMF群体结构分析的输入数据文件
- 系统发育树文件
- 文件名称:IQTREE_contree.tre
- 文件格式:TRE
- 字段映射介绍:IQTREE构建的一致树结果文件
- 群体遗传分析文件
- 文件名称:FSC_Analysis_Combined_MSFS.obs、FSC_Analysis1_MSFS.obs、FSC_Analysis2_MSFS.obs
- 文件格式:OBS
- 字段映射介绍:FastSimCoal2分析的多位点频谱(MSFS)观测数据文件
适用场景
- 生物入侵动态研究:分析红胸太阳鱼非本地种群的入侵路线及来源,揭示入侵扩散机制
- 淡水鱼类种群遗传学研究:利用基因组数据探讨种群遗传结构与分化
- 生物多样性保护:为红胸太阳鱼本土种群保护及非本地种群入侵管理提供科学依据
- 进化生物学研究:通过分歧时间分析探究物种进化历史与地理扩散关系
- 群体遗传模型验证:利用多位点频谱数据测试群体遗传模型的适用性