数据集概述
本数据集围绕油菜病原菌Leptosphaeria maculans的全球入侵展开,包含微卫星标记数据及种群结构分析参数文件,用于研究该病原菌的起源、入侵路径、繁殖系统变化及种群规模动态,为制定植物病害综合防控策略提供数据支撑。
文件详解
- 微卫星标记数据文件
- 文件名称:minisatellite data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含372个个体的14个微卫星位点基因型数据,支持种群遗传学分析
- 种群结构分析参数文件
- 文件名称:mainparams_no_geogr_prior.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:定义种群结构分析的核心参数,包括输出文件路径、输入数据文件、样本数量(372个)、位点数量(14个)、标签设置(LABEL=1)、种群数据标识(POPDATA=1)等
- 种群结构分析参数文件(含地理先验)
- 文件名称:mainparams_geogr_prior.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:在基础参数上增加地理先验信息的种群结构分析参数配置
- 种群结构分析结果文件
- 文件名称:structure_CC_geogr_prior_6grps.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:基于地理先验信息、设置6个种群分组的STRUCTURE分析结果数据
- 种群结构分析结果文件(无地理先验)
- 文件名称:structure_CC_no_geogr_prior.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:未使用地理先验信息的STRUCTURE分析结果数据
数据来源
论文“Migration patterns and changes in population biology associated with the worldwide spread of the oilseed rape pathogen Leptosphaeria maculans”
适用场景
- 植物病原菌入侵路径追溯: 利用微卫星标记数据重建Leptosphaeria maculans的全球扩散路线,识别关键入侵节点
- 种群遗传学特征分析: 通过STRUCTURE结果文件解析不同地理种群的遗传结构、多样性水平及分化程度
- 繁殖系统动态研究: 对比不同区域种群的克隆性水平与有性繁殖频率,揭示环境对病原菌繁殖策略的影响
- 入侵瓶颈效应评估: 结合种群结构数据推断病原菌入侵过程中的种群规模变化及瓶颈效应强度
- 病害防控策略制定: 基于入侵机制分析结果,优化油菜黑胫病的区域化防控及检疫措施