数据集概述
本数据集为新西兰特有斯图尔特岛鸬鹚(Leucocarbo chalconotus)的生物多样性研究数据,包含现代与古代DNA分析、放射性碳定年及贝叶斯建模相关文件,用于评估人类抵达对该物种的影响,揭示南岛东南部与最南端种群不同的数量变化历史。
文件详解
- 分析模型文件(.xml)
- 文件名称:BEAST 33 htype.xml、OtagoBSPr2.xml、FoveauxBSPr1.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:贝叶斯建模相关的配置文件,用于种群动态、系统发育等分析
- 序列比对文件(.fas、.nex)
- 文件名称:SIS aDNA Otago alignment.fas、SIS aDNA Foveaux alignment.fas、SISaDNA1perHap33.nex
- 文件格式:FAS、NEX
- 字段映射介绍:包含奥塔哥及福沃海峡地区古代DNA序列比对数据
- 代码文件(.txt)
- 文件名称:aDNA optomisation code.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:古代DNA数据优化代码,用于帮助用户筛选序列和位点以提升分析效力
- 文档文件(.docx)
- 文件名称:Translation Table.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:翻译表相关文档
- 压缩包文件(.zip)
- 文件名称:Randomisation Tests.zip、BayeSSC par files.zip、Otago_var_rates.zip、Foveaux_var_rates.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含随机化测试、BayeSSC参数文件、奥塔哥及福沃海峡地区变异率相关的压缩数据
数据来源
论文“Geographically contrasting biodiversity reductions in a widespread New Zealand seabird”
适用场景
- 生物多样性历史研究: 分析人类活动对新西兰海鸟种群分布及数量变化的影响
- 种群遗传学分析: 利用DNA序列数据研究斯图尔特岛鸬鹚不同地理种群的遗传多样性及演化历史
- 考古生物学交叉研究: 结合古代DNA与考古数据,揭示史前人类活动对岛屿生态系统的影响
- 贝叶斯建模应用: 验证贝叶斯方法在种群动态历史重建中的有效性
- 保护生物学研究: 为濒危海鸟的保护策略制定提供历史种群变化的科学依据