数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了ZZ15品系(lev-8(x15)X等位基因)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2010年2月19日进行,采用NGM低蛋白胨琼脂培养基和OP50食物源,通过tierpsy软件追踪分析线虫行为,包含特征数据、原始数据及wcon格式压缩文件三类文件。
文件详解
- 特征数据文件
- 文件名称:acr-13 or lev-8 (x15)X on food R_2010_02_19__13_02_23412_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征数据,基于tierpsy软件提取的21604个分割骨架相关特征
- 原始数据文件
- 文件名称:acr-13 or lev-8 (x15)X on food R_2010_02_19__13_02_23412.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验原始追踪数据,包含帧率(每秒约27帧)、视频像素与微米映射(每像素约4.4微米)等基础参数
- 压缩格式文件
- 文件名称:acr-13 or lev-8 (x15)X on food R_2010_02_19__13_02_23412.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:wcon格式行为数据的压缩包,用于标准化存储线虫行为轨迹信息
数据来源
MRC Laboratory of Molecular Biology(英国剑桥)
适用场景
- 线虫神经遗传学研究: 分析lev-8基因对秀丽隐杆线虫运动行为的调控机制
- 行为表型分析: 基于追踪的骨架特征数据,研究特定品系线虫的行为模式差异
- 实验方法验证: 参考E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为实验的标准化流程
- 生物图像分析算法测试: 利用标注的行为特征数据,优化或评估线虫行为追踪算法性能