数据集概述
本数据集记录了对两种新物种（ Phytophthora umbellatus sp.nov. 和 Phytopythium niubeiliangense sp.nov.）的分类学研究过程，包含形态学特征、多基因系统发育分析及线粒体基因组测序注释等相关数据，支持其作为新物种的分类学界定。
文件详解
该数据集包含多个目录和文件，具体说明如下：
- 系统发育分析文件：
- 目录（phytopythium tree upload/、P. umbellatus_tree upload/）下包含多种系统发育分析相关文件，如Bayes树、ML树、模型选择结果等
- 文件示例：summary and citation.txt（各分析步骤的摘要与引用说明）、input.nex（系统发育分析输入文件）、best_scheme_and_models.csv（模型选择结果表格）
- 线粒体基因组分析文件：
- 目录（for mitogenomic PCGs/）下包含线粒体基因组蛋白编码基因（PCGs）的系统发育分析文件
- 文件示例：common_PCGs.fas（PCGs序列文件）、common_PCGs_fas_iq_tree.treefile（ML树输出文件）
- 日志与配置文件：
- 日志文件（log.txt）记录分析过程的屏幕输出
- 配置文件（partition_finder.cfg）记录分区查找的参数配置
适用场景
- 真菌分类学研究：支持两种新物种的分类学验证与形态学特征分析
- 系统发育分析：用于多基因及线粒体基因组水平的系统发育树构建与模型选择研究
- 基因组学研究：可分析新物种线粒体基因组的基因排列特征
- 生物多样性研究：为亚热带及暖温带森林生态系统中的卵菌多样性研究提供数据支持
