数据集概述
本数据集包含百合目(Liliales)10个科的系统基因组学与历史生物地理学研究数据,基于35种29属百合目植物的75个质体基因及97个被子植物质体基因组,通过超级矩阵方法扩展至58属,结合17个化石日期校准进化时间线,揭示百合目起源于澳大利亚及通过南极洲的洲际分布历史。
文件详解
- 文件名称:135_Angiosperm_75CDS.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:包含135种被子植物的75个质体编码序列(CDS)数据,用于构建系统发育超级矩阵
- 文件名称:Liliales_2Genes_angiosperm.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:记录百合目及被子植物类群的2个基因相关元数据,支持系统发育分析的参数配置与数据关联
数据来源
论文“Phylogenomics and historical biogeography of the monocot order Liliales: out of Australia and through Antarctica”
适用场景
- 植物系统发育研究:分析百合目10个科的亲缘关系及进化分支时间
- 历史生物地理学分析:探究百合目起源于澳大利亚及通过南极洲扩散至南美洲、新西兰等地的洲际分布机制
- 长距离扩散事件研究:验证太平洋、塔斯曼海等区域的植物长距离扩散对物种分布的影响
- 被子植物质体基因组进化分析:基于75个质体基因数据研究被子植物类群的基因组进化规律
- 生物地理时间校准:利用17个化石日期校准的时间线,分析单子叶植物进化的关键节点