数据集概述
本数据集包含鸟类Liocichla属（雀形目：噪鹛科）的多基因位点分子系统发育研究数据，涵盖5个已识别物种的基因序列比对、系统发育分析文件及相关辅助数据，用于构建物种进化树、估算分化时间，支持亚洲鸟类多样化的生物地理假说验证。
文件详解
- 分析配置文件（XML）
- 文件名称：BEAST23_run1_analysis24.xml、BEAST23_run1_analysis23.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：BEAST软件系统发育分析的配置文件，包含分析参数设置、模型选择等元数据
- 补充信息文件（XLSX）
- 文件名称：Supplemental file 1 GenBank accession numbers.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录研究中使用的基因序列在GenBank数据库的登录号信息
- 序列比对文件（ZIP压缩包）
- 文件名称：Nexus alignments without MI and LB.zip、Nexus alignments ALL TAXA.zip
- 文件格式：ZIP（内含Nexus格式比对文件）
- 字段映射介绍：包含不同分类单元的基因序列比对数据，分为排除特定类群和包含所有类群两种版本
- 分析结果文件（ZIP压缩包）
- 文件名称：Combined results from BEAST gene only partitioned analysis.zip、Combined results from BEAST codon partitioned analysis.zip、BEAST analysis with gene partitioning and nuclear loci only.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：BEAST软件不同分析策略（基因分区、密码子分区、核基因位点仅分析）的系统发育分析结果压缩包
适用场景
- 鸟类系统发育研究：利用基因序列比对数据构建Liocichla属物种进化树，明确物种分类关系
- 生物地理演化分析：结合分化时间估算结果，验证亚洲地质气候事件对鸟类多样化的驱动作用
- 分子进化模型验证：通过不同分区策略的分析结果，比较基因位点或密码子水平的进化模型拟合度
- 生物信息学方法应用：作为BEAST等系统发育软件的实践数据集，支持相关分析流程的复现与优化
