数据集概述
本数据集围绕南美蜥蜴Liolaemus darwinii物种组的物种树推断展开，包含12个文件，涉及基因座、个体及序列长度采样策略对物种树准确性与精确性的影响分析，涵盖模拟数据、文档附录、序列文件等，用于评估*BEAST方法在不同采样策略下的性能。
文件详解
- 文档类文件（.docx格式，共7个）
- 文件名称：Appendix2.docx、Appendix3.docx、Appendix6.docx、Appendix7.docx、Appendix8.docx等
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：包含研究相关的附录内容，可能涉及采样策略说明、方法细节、结果补充等文本信息
- 文本类文件（.txt格式，共3个）
- 文件名称：phase_output.txt、datasets.txt、phase_nexus.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：phase_output.txt为PHASE v2.1.1软件输出结果；datasets.txt记录数据集相关信息；phase_nexus.txt包含Nexus格式相关文本内容
- 压缩文件（.tgz格式，共1个）
- 文件名称：xml_files.tgz
- 文件格式：TGZ
- 字段映射介绍：压缩包内包含XML格式文件，推测为*BEAST分析相关的配置或输入文件
- 模拟数据文件（.nex格式，共1个）
- 文件名称：simulations.nex
- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：Nexus格式的模拟数据文件，用于物种树推断的模拟分析
数据来源
论文“Accuracy and precision of species trees: effects of locus, individual, and base-pair sampling on inference of species trees of the Liolaemus darwinii group (Squamata, Liolaemidae)”
适用场景
- 分子系统发育方法评估：分析*BEAST方法在不同采样策略下推断Liolaemus darwinii物种组物种树的准确性与精确性
- 采样策略优化研究：探究基因座数量、个体数量及序列长度对物种树推断结果的影响，确定最优采样范围
- 物种树推断影响因素分析：结合数据研究基因流、信息含量、树形状等因素对物种树性能的潜在影响
- 分子进化研究：为Liolaemus darwinii物种组的系统发育关系及进化历史研究提供数据支持
