数据集概述
本数据集围绕栗腰针尾雀（Cranioleuca pyrrhophia）展开，包含其基因与表型数据，用于研究该雀形目鸟类在南美干旱森林梯度下的基因流分化与表型演化关系，为理解物种形成机制提供数据支持。
文件详解
- 文档文件：
- README.txt：说明数据集用途及各文件内容，包含样本ID、经纬度等基础信息
- params-cranioleuca.txt：ipyrad参数文件（v.0.9.84），记录基因组组装参数
- 表型数据文件（CSV格式）：
- Crown_processed.csv：冠部颜色数据（pavo 2.0分析），含样本ID、经纬度
- Wcoverts_processed.csv：翼覆羽颜色数据（pavo 2.0分析），含样本ID、经纬度
- Back_processed.csv：背部颜色数据（pavo 2.0分析），含样本ID、经纬度
- Ext_tail_processed.csv：尾羽外部颜色数据（pavo 2.0分析），含样本ID、经纬度
- Central_tail_processed.csv：尾羽中央颜色数据（pavo 2.0分析），含样本ID、经纬度
- DB_Cpyrrhophia_procesado-morphology-DRYAD.csv：形态测量数据，含180个标本的体型数据
- 基因组数据文件：
- cranioleuca.vcf：变异位点数据（VCF格式）
- cranioleuca.phy：系统发育分析数据（PHYLIP格式）
- cranioleuca.gphocs：种群遗传分析数据（G-PhoCS格式）
- cranioleuca.loci：ddRAD测序位点数据
- cranioleuca.nex：系统发育分析数据（NEXUS格式）
- cranioleuca.ustr：序列数据文件
适用场景
- 进化生物学研究：分析基因流分化与表型演化的关联机制
- 生物地理学研究：探讨干旱森林梯度对鸟类种群分化的影响
- 功能基因组学研究：解析表型性状（如羽色）的遗传基础
- 保护生物学研究：评估栗腰针尾雀不同亚种的遗传多样性与适应性
- 形态学研究：分析体型与羽色性状的地理变异模式
