数据集概述
本数据集为长PCR结合下一代测序（NGS）的分子系统研究方法相关数据，包含30种被子植物叶绿体基因组扩增测试结果，以及58对潜在通用引物信息。数据还涉及Illumina HiSeq 2000测序的扩增子信息，适用于分子系统研究中DNA模板生成与测序分析，共含2个文件。
文件详解
- 文件名称：README_for_Uribe-Convers_Chloroplast_Assemblies.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含Orobanchaceae科3个属（Bartsia、Castilleja、Lamourouxia）叶绿体组装的contigs、ACE文件等结果说明，记录了长PCR扩增子与Illumina HiSeq 2000 NGS数据结合的组装流程（使用Alignreads v2.25 pipeline），样本以Tank1、Tank2等连续标签命名，物种对应关系见"Species_List_by_library.txt"。
- 文件名称：Uribe-Convers_Chloroplast_Assemblies.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包内包含叶绿体组装相关的原始数据文件，具体内容需解压后查看。
数据来源
论文“A long PCR based approach for DNA enrichment prior to next-generation sequencing for systematic studies”
适用场景
- 分子系统发育研究：用于测试长PCR结合NGS的DNA富集方法在被子植物叶绿体基因组扩增中的应用效果。
- 引物设计参考：基于58对潜在通用引物，优化被子植物叶绿体基因组扩增的PCR条件。
- 测序技术应用：分析Illumina HiSeq 2000测序平台对长PCR扩增子的测序表现。
- 基因组学方法开发：探索长PCR方法在核基因区域等其他基因组片段测序中的潜在应用。
