数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C. elegans)LSJ1品系的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了2011年3月7日在英国剑桥MRC分子生物学实验室开展的实验,包含线虫在NGM低蛋白胨培养基上的行为观测数据,涉及视频追踪、特征提取等信息,可用于线虫行为学分析。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:300 LSJ1 on food R_2011_03_07__11_11_0471.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为观测的原始追踪数据
- 特征数据文件
- 文件名称:300 LSJ1 on food R_2011_03_07__11_11_0471_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征提取数据,涉及26528个分段骨架等特征
- 压缩数据文件
- 文件名称:300 LSJ1 on food R_2011_03_07__11_11_0471.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为数据的压缩文件,采用wcon格式存储
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫行为学研究: 分析LSJ1品系线虫在特定培养基上的运动模式、行为特征及时空变化
- 实验方法验证: 基于E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为观测的标准化流程
- 生物信息学分析: 利用特征数据文件中的骨架信息,开展线虫行为的量化分析
- 实验室重复实验参考: 为其他实验室开展同类线虫行为实验提供实验设计、参数设置的参考依据