数据集概述
本数据集是基于生物信息学分析识别卵巢癌关键预后基因的研究资料,包含WGCNA、LASSO分析、免疫浸润、药物敏感性等多维度分析结果,以及临床数据图表和IHC摄影资料,为卵巢癌预后基因研究提供数据支持。
文件详解
该数据集包含多个目录和文件,具体说明如下:
- LASSO分析文件:
- 文件名称: gene_index.csv(CSV格式),记录LASSO分析中的基因索引信息
- 文件名称: lasso-1.pdf、lasso-2.pdf(PDF格式),LASSO分析结果图表
- 临床数据与IHC摄影文件:
- 文件名称: CCDC80 survival.tiff、fbxo16 survival.tiff(TIFF格式),生存分析图表
- 文件名称: ccdc80IHC.zip、FBXO16 IHC.zip(ZIP格式),IHC实验资料压缩包
- 文件名称: clinical data statistic graph.xlsx(XLSX格式),临床数据统计图表
- 药物敏感性分析文件:
- 文件名称: ccdc80 ic50.pdf、fbxo16 ic50.pdf(PDF格式),药物敏感性分析结果
- GEPIA KM分析文件:
- 文件名称: CCDC80GEPIA.pdf、FBXL16 GEPIA.pdf、kmFBXO16OS.pdf、kmCCDC80OS.pdf(PDF格式),GEPIA平台KM生存分析结果
- 免疫浸润与表达文件:
- 文件名称: CCDC80.pdf、FBXO16.pdf(PDF格式),免疫浸润分析结果
- 突变与GSVA分析文件:
- 文件名称: oncoprint.pdf、CCDC80-gsva.pdf、FBXO16-gsva.pdf(PDF格式),突变与GSVA分析结果
- 通路分析与PPI文件:
- 文件名称: KEGG.txt、GO.txt(TXT格式),通路分析结果文本
- 文件名称: 1.GObubble.pdf、2.KEGGbubble.pdf、1.GObarplot.pdf、2.KEGGbarplot.pdf(PDF格式),GO/KEGG富集分析图表
- 文件名称: 3.PPI network-s8oRk1.pdf(PDF格式),PPI网络分析结果
- Venn分析文件:
- 文件名称: intersect.txt(TXT格式),基因交集信息
- 文件名称: venn.pdf(PDF格式),Venn图分析结果
- WGCNA分析文件(GSE14001数据集):
- 文件名称: 2_scale_independence-9AF2kP-rhcagT.pdf等(PDF格式),WGCNA分析相关图表
- 文件名称: softpower=6L-pbjcgQ-v48Crz.txt(TXT格式),软阈值计算结果
- 文件名称: GS_MM-sVhMQv-3Em0rC.xls(XLS格式),基因显著性与模块 membership 数据
- WGCNA分析文件(GSE54388数据集):
- 文件名称: 2_scale_independence.pdf等(PDF格式),WGCNA分析相关图表
- 文件名称: softpower=16L.txt(TXT格式),软阈值计算结果
- 文件名称: GS_MM.xls(XLS格式),基因显著性与模块 membership 数据
数据来源
NCBI GEO公共数据库
适用场景
- 卵巢癌预后基因研究: 分析CCDC80、FBXO16等基因与卵巢癌预后的关联
- 免疫浸润分析: 探究预后基因与免疫细胞含量的相关性
- 药物敏感性研究: 分析预后基因对化疗药物IC50值的影响
- 临床转化应用: 基于预后基因开发卵巢癌诊断与治疗靶点
- 生物信息学方法验证: 验证WGCNA、LASSO等分析方法在癌症预后研究中的应用