数据集概述
本数据集为论文《Gamma-Hemolysin Components: Computational Strategies for LukF-Hlg2 Dimer Reconstruction on a Model Membrane》的支持信息，包含多个文件夹，记录了LukF-Hlg2二聚体在模型膜上重建的计算模拟数据，涉及距离、位移、界面面积、角度等关键参数的模拟结果。
文件详解
- 核心模拟结果文件
- 文件夹：LukF_Hlg2_distance、HADDOCK_dimer_crystal_pore_displacement、interface_area、angles、HADDOCK_scores、RMSD、RMSF、interaction_persistences、distance_protein_membrane、distance_residues_interface
- 对应压缩文件：如RMSF.zip、distance_protein_membrane.zip等
- 文件格式：ZIP（包含具体模拟数据文件）
- 内容说明：分别记录LukF与Hlg2的距离随时间变化、HADDOCK模型与晶体孔中结构的位移、单体间界面面积、角度分布、HADDOCK模型得分、RMSD/RMSF值、相互作用持久性矩阵、蛋白质与膜的距离、界面残基距离等模拟结果
- 说明文件
- 文件名称：README.rtf
- 文件格式：RTF
- 内容说明：数据集的相关说明文档
数据来源
论文“Gamma-Hemolysin Components: Computational Strategies for LukF-Hlg2 Dimer Reconstruction on a Model Membrane”
适用场景
- 蛋白质二聚体结构模拟研究：分析LukF-Hlg2二聚体在膜上的自发二聚过程及结构变化
- 蛋白质相互作用机制分析：利用相互作用持久性矩阵研究二聚体界面的氢键、盐桥等相互作用
- 计算模型验证：对比HADDOCK预测模型与晶体结构的差异，评估计算策略的准确性
- 膜蛋白结构功能研究：探究LukF-Hlg2二聚体与膜的相互作用及对其功能的影响
