数据集概述
本数据集包含重新评估MacArthur莺类生态位分化的相关数据与代码,涉及莺类形态测量、觅食行为及粪便宏条形码饮食分析,结合系统发育框架研究物种竞争与生态位分化机制,共32个文件,涵盖原始数据、处理脚本及分析结果。
文件详解
- 数据文件
- 形态与生态数据:
rawMorpho.RDS(RDS格式,原始形态测量数据)、ecolRaw.RDS(RDS格式,原始生态学数据)、TableS1.xlsx(XLSX格式,补充表格数据)
- 饮食数据:
family_level_average_proportion_by_species.csv(CSV格式,物种饮食中各科无脊椎动物平均比例)、taxonomyCrosswalk.tsv(TSV格式,分类学对照表)
- 系统发育数据:
newWarblerTree.tre(TRE格式,莺类系统发育树)、tree_rooted.nwk(NWK格式,有根系统发育树)
- 代码文件
- 分析脚本:
cca&phyloModels_MarkMyBirdMorpho.R(R格式,CCA与系统发育模型分析)、orderLevelBarPlots.R(R格式,目水平饮食条形图绘制)、diet_qiime_scripts_zenodo.sh(SH格式,QIIME2饮食分析脚本)
- 元数据文件
qiime_diet_metadata_17_21.tsv(TSV格式,QIIME2饮食分析元数据)、jetzCrosswalk.csv(CSV格式,物种名称对照表)
数据来源
论文“Re-assessing niche partitioning in MacArthur's Warblers: foraging behavior, morphology, and diet differentiation in a phylogenetic context”
适用场景
- 鸟类生态学研究:分析莺类形态、觅食行为与饮食的关联,探究生态位分化机制
- 系统发育生态位分析:结合系统发育树研究莺类生态位分化的进化历史
- 宏条形码饮食分析:利用粪便宏条形码数据研究鸟类食性组成
- 生态竞争机制研究:验证MacArthur经典结论,探讨物种共存与竞争的进化影响