数据集概述
本数据集是论文《Macroalgal genomics illuminate three paths to multicellularity》的补充表格数据，包含5个多工作表Excel文件，覆盖大型藻类物种功能注释、基因本体富集、微藻与大型藻比较基因组学、大型藻粘附组及内源性病毒元件等关键研究内容，为解析大型藻类多细胞性进化机制提供基因组层面的支撑数据。
文件详解
- Table S1. Functional annotation and metadata for macroalgal species
- 文件名称：TABLE_S1_PFAM_matrix_META_JAN23rd2024.xlsx
- 文件格式：XLSX（多工作表）
- 字段映射介绍：包含去污染组装的PFAM计数矩阵、菌株元数据、污染估计值、组装指标（BUSCO、N50得分）及三元分析源数据，关联图2、3。
- Table S2. GO enrichment in macroalgal-specific genes
- 文件名称：TABLE_S2_ByPhylaResponseScreen-Ternary-Venn-dcGO-19th2023.xlsx
- 文件格式：XLSX（多工作表）
- 字段映射介绍：包含红藻、褐藻、绿藻中保守的大型藻特异性PFAM的富集GO术语，以及不同门类间PFAM计数均值比较的响应筛选结果，关联图3。
- Table S3. Comparative genomics of micro- and macroalgae
- 文件名称：Table_S3_BIG_MicroMacro_Meta_PFAM_matrix_RSs-Dec19th.xlsx
- 文件格式：XLSX（多工作表）
- 字段映射介绍：包含微藻与大型藻间PFAM和GO变异比较的响应筛选表，关联图4。
- Table S4. Unraveling the macroalgal adhesome
- 文件名称：TABLE_S4_MacroalgalAdhesome_and_RS_Dec19th2023.xlsx
- 文件格式：XLSX（多工作表）
- 字段映射介绍：包含大型藻粘附组图谱、大型藻门类间及微藻与大型藻间的响应筛选结果，关联图4。
- Table S5. Endogenous viral elements in macroalgae
- 文件名称：TABLE_S5_VFAMs_EVOPS_RSs_EsV-1-7.xlsx
- 文件格式：XLSX（多工作表）
- 字段映射介绍：包含VFAM计数矩阵、不同气候和栖息地大型藻VFAM计数比较的响应筛选结果，以及EVOP矩阵、不同气候和大型藻基因组中EVOP比较的响应筛选结果。
数据来源
论文“Macroalgal genomics illuminate three paths to multicellularity”
适用场景
- 藻类多细胞性进化机制研究: 分析大型藻特异性基因、粘附组及病毒来源基因在多细胞表型演化中的作用。
- 海洋藻类基因组功能注释: 利用PFAM计数矩阵和GO富集数据，解析大型藻基因组的功能特征与分类差异。
- 微藻与大型藻比较基因组学: 通过基因组指标和基因家族变异比较，探究两类藻类的进化分异。
- 环境适应性研究: 结合气候、栖息地元数据，分析大型藻内源性病毒元件的环境关联及生态适应机制。
- 生物技术应用支撑: 挖掘大型藻在生物固碳、生态工程中的关键基因资源与功能基础。
