数据集概述
本数据集为被子植物叶绿体序列交配系统选择效能研究的相关数据,用于验证自交是否降低选择效能(尤其是纯化选择)的假设。通过比较自交与异交谱系的Dn/Ds比率进行分析,发现自交谱系存在选择放松趋势但统计支持较弱,结果与自交谱系近期起源或古老起源但有害突变对灭绝动态无显著影响的情况相符。
文件详解
- Alignements.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包文件,推测包含被子植物叶绿体序列的比对数据,用于后续的分子进化分析(如Dn/Ds比率计算)。
- Trees.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含系统发育树信息,如标注有SELF分支的Asteraceae_matK.tree,记录了向日葵属、金光菊属等植物的系统发育关系,用于区分自交与异交谱系分支。
适用场景
- 植物分子遗传学研究: 分析被子植物叶绿体序列中自交与异交谱系的Dn/Ds比率,验证选择效能相关假设。
- 进化生物学分析: 探讨自交对植物谱系选择压力的影响,研究有害突变在自交群体中的积累动态。
- 系统发育树构建与应用: 利用Trees.txt中的系统发育树信息,区分自交与异交分支,开展谱系特异性进化分析。
- 植物交配系统进化研究: 结合叶绿体序列比对数据,探究自交起源时间与有害突变对种群灭绝的影响机制。