数据集概述
本数据集为套细胞淋巴瘤（MCL）单细胞转录组学研究的补充数据，包含6张Excel表格和1个RDS对象，记录了4例患者诊断及复发阶段的基因组异常、差异基因表达、细胞周期分析、亚克隆特征、拷贝数变异及体细胞变异等信息，核心揭示诊断时存在的治疗耐药亚克隆特征。
文件详解
- Supplementary Table 4.xlsx（XLSX）：患者P009的光学基因组图谱结果，列出诊断与复发共享及各时间点独有的基因组异常
- Supplementary Table 5.xlsx（XLSX）：4例患者复发与诊断MCL细胞的差异基因表达分析（Sheet A）及GO生物过程富集分析（Sheet B）
- Supplementary Table 6.xlsx（XLSX）：4例侵袭性MCL患者诊断（DG）与复发（REL）时细胞周期四阶段（G0、G1、S、G2M）的细胞比例及卡方检验结果
- Supplementary Table 7.xlsx（XLSX）：CNV推断检测的淋巴瘤亚克隆特征，含亚克隆细胞计数与比例（Sheet A）及亚克隆CNV图谱（Sheet B）
- Supplementary Table 8.xlsx（XLSX）：耐药与敏感MCL亚克隆的差异基因表达分析，含亚克隆比较 summary（Sheet A）、差异基因列表（Sheet B）、GO富集分析（Sheet C）及Hallmark基因集富集分析（Sheet D）
- Supplementary Table 9.xlsx（XLSX）：患者P069样本的体细胞变异，含基因组坐标、变异等位基因频率、基因型及功能注释
- Supplementary Data SingleCellExperiment object.rds（RDS）：57751个QC后细胞、36601个基因的SingleCellExperiment对象，含样本、患者、时间点、细胞类型、细胞周期、肿瘤亚克隆等注释字段
数据来源
论文“Single Cell RNA Transcriptomics of Mantle Cell Lymphoma Reveals the Presence of Treatment-Resistant Subclones at the Time of Diagnosis”
适用场景
- 淋巴瘤耐药机制研究：分析诊断时存在的治疗耐药亚克隆特征及复发时的克隆演化规律
- 差异基因表达分析：探究复发与诊断阶段、耐药与敏感亚克隆间的关键差异表达基因及功能通路
- 基因组异常分析：研究MCL患者诊断与复发的基因组变异、拷贝数变异及体细胞突变特征
- 亚克隆演化研究：基于细胞计数、比例变化及CNV图谱，解析MCL亚克隆的治疗敏感性及动态变化
- 临床转化应用：为MCL早期耐药亚克隆的检测及靶向治疗策略开发提供数据支持
