数据集概述
本数据集为论文《Selected Phenolic Acids – FRAP Assay and QSAR Analysis of the Structural Features》的配套数据,包含用于研究酚酸类化合物抗自由基活性的分子几何结构文件。数据涵盖完整的分子结构及其自由基形式,支持FRAP实验结果的复现和定量构效关系分析。数据集共包含145个文件,按分子类型和自由基位点系统组织。
文件详解
- 分子结构文件(Molecules)
- 文件名称: 如
2-hydroxybenzoic.xyz、3,4-dihydroxybenzoic.xyz等
- 文件格式: XYZ
- 字段映射介绍: 包含完整酚酸分子的三维原子坐标,文件通常以分子名称命名,记录原子的元素符号和空间位置。
- 自由基结构文件(Radicals)
- 文件名称: 遵循
Radicals/[分子名称]/[碳位点]/[分子名称]_[构象标识].xyz模式(例如:Radicals/2,3-dihydroxybenzoic/C2/2,3-dihydroxybenzoic_A.xyz)
- 文件格式: XYZ
- 字段映射介绍: 包含特定酚酸分子在不同碳原子位点(如C2, C3, C4, C5)形成自由基后的多种可能构象的三维结构,文件名中的字母标识不同构象异构体。
数据来源
论文“Antiradical Activity of Selected Phenolic Acids – FRAP Assay and QSAR Analysis of the Structural Features”, MDPI Molecules, 2020
适用场景
- 定量构效关系研究: 用于建立酚酸类化合物的分子结构特征与其FRAP测定抗自由基活性之间的QSAR模型。
- 计算化学与分子模拟: 作为初始结构,用于进行分子动力学模拟、量子化学计算以预测反应活性或稳定性。
- 抗氧化剂机理研究: 分析不同酚酸及其自由基的结构差异,探讨其清除自由基的潜在反应机理和活性位点。
- 化学信息学与数据挖掘: 作为结构数据集,用于开发分子描述符或训练机器学习模型预测化合物的抗氧化性能。