数据集概述
本数据集为蒺藜苜蓿结瘤因子(NFs)与生长素互作机制研究的补充表格,包含全基因组转录组分析结果。研究通过NF和/或生长素处理,揭示两者信号通路的重叠及协同互作,将差异表达基因分为三类互作组,涉及信号转导、代谢等功能,是解析豆科植物共生与侧根发育分子机制的关键数据。
文件详解
- 补充表格文件(共9个)
- 文件名称:tableS9_synergy_group3.xlsx、Table_S2_NAA.xlsx、tableS4_NAA_and NF_DEG.xlsx、TableS5_synergy_group1.xlsx、TableS6_DEGNF+NAAvsNAA.xlsx、TableS1_primers.xlsx、TableS7_synergy_group2vf.xlsx、TableS8_revised.xlsx(未完整列出所有9个文件,示例为提供的样本文件)
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含三类互作组基因(NF与生长素协同、NF增强/拮抗生长素调控、生长素拮抗NF调控)的差异表达数据、引物序列、转录组分析结果等,具体字段因表格功能而异,如基因ID、表达量变化、注释信息等。
数据来源
论文“Nod factors potentiate auxin signaling for transcriptional regulation and lateral root formation in Medicago truncatula”
适用场景
- 豆科植物共生信号通路研究:分析结瘤因子与生长素在根瘤共生建立中的分子互作机制。
- 植物侧根发育调控分析:探究结瘤因子刺激蒺藜苜蓿侧根形成的早期分子步骤。
- 转录组协同效应研究:解析结瘤因子与生长素组合处理下的基因表达协同或拮抗模式。
- 植物激素信号交叉对话研究:挖掘结瘤因子与生长素信号通路重叠的关键基因与功能模块。