数据集概述
本数据集源于美洲鼠兔(Ochotona princeps)景观遗传与网络分析研究,覆盖美国西部八个联邦管理站点。通过基因流阻力评估、栖息地斑块网络建模,分析景观与气候变量对功能连通性的影响,识别限制扩散的关键因素(如南向坡、地形起伏等),为物种保护提供实证支持。含5个文件,包括栅格、矩阵、样本位置等数据。
文件详解
- Castillo_Ressitance_Rasters.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 内容说明:包含景观阻力栅格数据,反映不同景观要素对美洲鼠兔基因流的阻力值,用于量化地形、气候等变量对扩散的影响
- Castillo_Patch_Distance_Matrices.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 内容说明:栖息地斑块间距离矩阵,记录各研究站点内栖息地斑块的空间距离关系
- Castillo_Genetic_Distance_Matrices.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 内容说明:基因距离矩阵,基于美洲鼠兔基因型数据计算的个体或种群间遗传差异
- Castillo_Patch_Centroids.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 内容说明:栖息地斑块质心数据,记录各斑块的空间中心坐标,用于网络建模与连通性分析
- Castillo_Sample_Localities.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射:包含Sample_ID(样本编号)、Zone(区域)、X(横坐标)、Y(纵坐标),记录美洲鼠兔样本的采集位置信息
数据来源
论文“Replicated landscape genetic and network analyses reveal wide variation in functional connectivity for American pikas”
适用场景
- 景观遗传学研究:分析地形、气候变量对美洲鼠兔基因流的阻力机制,探究功能连通性的空间变异
- 生物保护规划:识别维持功能连通性的关键栖息地斑块,为破碎化区域的保护管理提供靶点
- 气候变化影响评估:研究气候相关景观特征对物种连通性的影响,预测气候变化下的连通性变化趋势
- 栖息地网络建模:利用斑块距离、质心数据构建功能连通性网络,分析栖息地破碎化程度与扩散能力的关系
- 种群遗传学分析:通过基因距离矩阵研究美洲鼠兔种群遗传结构与空间自相关性,揭示分散栖息地中的扩散规律