数据集概述
本数据集围绕Mesocarabus甲虫的物种界定展开,整合了分子系统发育、形态测量和生态位分化等多源数据,通过分析不同性状间的冲突,提出了包含杂交谱系的物种界定策略。数据集涵盖DNA序列比对、形态测量及系统发育分析文件,为研究该类群的进化历史与物种边界提供支持。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称:README_for_Pronotum_outlines_Harmonics_297_Mesocarabus.txt、README_for_Sequence_Alignment_9DNA_Fragments_Mesocarabus.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:分别说明297份Mesocarabus前胸背板轮廓的椭圆傅里叶分析方法,以及9个DNA片段序列比对的相关信息。
- 序列比对文件
- 文件名称:Sequence_Alignment_9DNA_Fragments_Mesocarabus.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:包含9个DNA片段的序列比对数据,用于分子系统发育分析。
- 形态测量文件
- 文件名称:Pronotum_outlines_Harmonics_297_Mesocarabus.nef
- 文件格式:NEF
- 字段映射介绍:记录297份Mesocarabus前胸背板轮廓的傅里叶谐波数据,用于形态测量分析。
- 系统发育分析输入文件
- 文件名称:RIBosomal_combined_dataset_BEAST_imput.xml、HUWE1_BEAST_imput.xml、LSUa_BEAST_imput.xml、MITochondrial_combined_dataset_BEAST_imput.xml、LSUb_ITS2_BEAST_imput.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:共5个BEAST分析输入文件,分别对应核糖体联合数据集、HUWE1基因、LSUa基因、线粒体联合数据集、LSUb与ITS2联合数据集的系统发育分析参数设置。
数据来源
论文“Integration of conflict into integrative taxonomy: fitting hybridization in species delimitation of Mesocarabus (Coleoptera: Carabidae)”
适用场景
- 物种界定研究:利用多源数据冲突分析,优化Mesocarabus甲虫的物种划分方案。
- 分子系统发育分析:基于DNA序列比对数据,重建Mesocarabus的进化关系。
- 形态测量学研究:通过前胸背板轮廓数据,分析物种间的形态差异。
- 杂交与基因渐渗分析:探究Mesocarabus类群中杂交事件对物种形成的影响。
- 整合分类学方法应用:验证多性状冲突整合在物种界定中的有效性。