数据集概述
本数据集为红腿白臀叶猴饮食分析实验数据，对比宏基因组测序与 metabarcoding 两种方法的有效性。基于两份粪便样本的测序结果，包含方法对比结果、物种鉴定数据及原始序列文件，可用于评估不同分子方法在动物饮食研究中的应用价值。
文件详解
- 说明文件（.txt）
- 文件名称：README_for_PE_identifications_98.txt、README_for_metabarcoding_identifications_95.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：分别说明宏基因组配对末端分析（PE_identifications_98.xlsx）和 metabarcoding 分析（metabarcoding_identifications_95.xlsx）的结果内容、数据来源及解读方式
- 结果文件（.xlsx）
- 文件名称：metabarcoding_identifications_95.xlsx、PE_identifications_98.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含饮食植物物种鉴定结果，其中 PE_identifications_98.xlsx 含 pn1_summary、pn2_summary 等10个工作表，记录宏基因组方法鉴定的属/种列表及条码数量统计；metabarcoding_identifications_95.xlsx 记录 metabarcoding 方法的物种鉴定结果
- 原始序列文件（.gz）
- 文件名称：AmetPN1.fasta.gz、AmetPN2.fasta.gz
- 文件格式：FASTA.GZ
- 字段映射介绍：粪便样本的原始测序序列压缩文件，包含宏基因组测序产生的配对末端 reads 数据
数据来源
论文“Comparing the effectiveness of metagenomics and metabarcoding for diet analysis of a leaf-feeding monkey (Pygathrix nemaeus)”
适用场景
- 动物饮食分析方法评估：对比宏基因组与 metabarcoding 在灵长类饮食研究中的物种鉴定效率、准确性及覆盖度
- 分子生态学研究：分析粪便样本中植物 DNA 检测方法的敏感性与特异性，优化濒危物种非侵入性监测技术
- 生物信息学方法开发：基于测序数据改进饮食物种鉴定的生物信息学流程，提升低丰度物种检测能力
- 濒危物种保护：利用非侵入性粪便样本数据，研究红腿白臀叶猴的食性偏好与栖息地需求，为保护策略提供依据
