数据集概述
本数据集为中国阿勒泰、蒙古、泗水毛皮三个绵羊品种的基因定位研究数据,包含96只绵羊(34只两角、32只四角)的54241个SNP位点原始数据及样本信息,用于定位四角表型相关遗传区域、验证无角位点,支持绵羊角发育遗传机制研究。
文件详解
- 说明文件(Document files)
- 文件名称:
README_for_96 Chinese sheep.txt、README_for_96_ChineseSheep.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:说明数据集内容,包括SNP位点数量、样本品种及数量(43只阿勒泰羊、30只蒙古羊、22只泗水毛皮羊)、数据格式(PLINK格式)等核心信息。
- 基因型数据文件(Data files)
- 文件名称:
96_ChineseSheep.ped(PED格式)、96_ChineseSheep.map(MAP格式)
- 文件格式:PED、MAP
- 字段映射介绍:PLINK格式的基因型数据,包含96只绵羊的54241个SNP位点遗传信息,用于基因定位分析。
- 样本信息文件(Data files)
- 文件名称:
96 Chinese sheep.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录96只绵羊的样本编号、来源位置、群体聚类归属等样本基础信息。
数据来源
论文“Data from: Mapping the four-horned locus and testing the polled locus in three Chinese sheep breeds”
适用场景
- 绵羊角发育遗传机制研究: 用于分析四角表型相关遗传区域及无角位点验证,探究角发育的分子调控机制。
- 畜牧遗传育种应用: 为绵羊角性状相关的分子标记开发和遗传改良提供数据支持。
- 动物遗传学方法验证: 验证GWAS、PCR等技术在绵羊遗传性状定位中的应用效果。
- 绵羊群体遗传分析: 基于样本群体聚类信息,研究不同绵羊品种的遗传结构差异。