数据集概述
本数据集围绕鸟类与哺乳动物免疫基因的正选择展开研究，通过分析39种鸟类的同源蛋白编码基因序列，识别出11000个保守基因中的正选择基因，并发现免疫、重组等功能通路富集正选择基因；与哺乳动物数据对比显示跨类群共享正选择基因富集于病毒免疫通路，且 pathogen 刺激下上调的基因也富集正选择基因，揭示病原体（尤其是病毒）在进化中对相同基因的靶向作用。
文件详解
- 文件名称：R_data_and_scripts.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含研究中用于分析免疫基因正选择的R语言数据及脚本文件，可能涉及基因选择参数估算、通路富集分析、跨类群比较等相关数据与代码逻辑
- 文件名称：comparative_genomics_hog_alignments.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含比较基因组学研究中同源基因群（HOG）的序列比对文件，支撑鸟类与哺乳动物间正选择基因的同源性分析及选择压力参数估算
数据来源
论文“Immune genes are hotspots of shared positive selection across birds and mammals”
适用场景
- 进化基因组学研究：分析鸟类与哺乳动物间免疫基因的正选择模式及跨类群共享机制
- 宿主-病原体协同进化研究：探究病毒等病原体对宿主基因的靶向选择及长期进化冲突
- 功能基因组学分析：识别免疫、重组等通路中受正选择的关键基因及其功能意义
- 比较基因组学应用：通过同源基因比对数据开展不同类群间基因选择压力的比较研究
