数据集概述
本数据集为微生物表面扩张碰撞动力学实验数据,聚焦表面定殖微生物的克隆扩张与群落碰撞过程,通过实验与模拟验证该动态对合作型与缺陷型菌株共存的促进作用,包含实验数据与模拟代码,共二十个文件。
文件详解
- 数据文件(.xlsx/.xls格式,共17个)
- 示例文件:2v9_nobenefit.xlsx、2v8_8neighbors.xlsx、2v8_rareinvasion.xls等
- 内容说明:记录不同实验条件下的菌株竞争数据,如有无空间结构、不同邻居数量、入侵频率等场景下的菌株频率变化
- 代码文件(.m格式,共3个)
- 示例文件:cooperation1cdDVD_deterministic_evenlydistributed_rareinvasion.m、cooperation1cdDVD_Noweighingdispersalv1.m等
- 内容说明:用于空间模拟的MATLAB代码,实现确定性分布、扩散权重设置等模拟逻辑
数据来源
论文“Microbial expansion-collision dynamics promote cooperation and coexistence on surfaces”
适用场景
- 微生物生态学研究:分析表面定殖微生物的扩张碰撞动态对种群结构的影响
- 合作行为进化研究:验证扩张-边界竞争交替对合作型与缺陷型菌株共存的促进机制
- 实验条件优化分析:探究初始密度、合作成本等参数对菌株频率稳态的调控作用
- 空间模拟方法应用:基于MATLAB代码复现或扩展微生物空间竞争的模拟实验