数据集概述
本数据集为Maria Zimmermann-Kogadeeva与Josef Ecker团队合作项目的一部分,包含团队在OMM12群落定植小鼠中生成的蛋白质组学、脂质组学研究数据,以及用于蛋白质组学分析参考的Duparc等人研究数据、ExpressionAtlas公共数据和UNIPROT的基因ID映射文件,以压缩包形式存储。
文件详解
- 文件名称:Data_archive.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含五个子文件夹,分别为:
- proteomics_data:OMM12群落定植小鼠的蛋白质组学研究数据
- lipidomics data:OMM12群落定植小鼠的脂质组学研究数据
- Duparc_et_al:Duparc等人2017年关于肝细胞MyD88影响胆汁酸、肠道菌群及代谢组的研究数据
- expression_atlas:从ExpressionAtlas下载的公共数据
- UNIPROT:Affymetrix小鼠UNIPROT ID映射文件
数据来源
Maria Zimmermann-Kogadeeva与Josef Ecker团队合作项目
适用场景
- 微生物组与脂质代谢机制研究:分析OMM12群落对小鼠脂质代谢的调控作用及相关分子机制
- 蛋白质组学与脂质组学关联分析:整合蛋白质组学和脂质组学数据,探究二者在微生物组影响下的相互作用
- 公共数据参考验证:利用Duparc等人研究数据及ExpressionAtlas公共数据,验证团队研究结果的可靠性
- 基因ID映射应用:通过UNIPROT的ID映射文件,实现蛋白质组学数据与基因信息的关联分析