数据集概述
本数据集围绕小鼠肝脏中microRNAs（miRNAs）对昼夜节律基因表达的调控作用展开，包含基因注释、测序计数表及补充文件等6个文件。核心内容为肝脏miRNA生物发生失活后的转录组测序结果，揭示miRNAs对核心时钟及输出基因表达的影响，涉及约30%节律转录组的相位和振幅调控，为研究组织特异性时钟驱动基因表达机制提供数据支持。
文件详解
- 说明文档类
- 文件名称：README_for_annotations.tar.txt、README_for_count_tables.tar.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：分别对应基因注释文件和计数表文件的说明文档，包含数据背景、文件内容概述等信息
- 压缩归档类
- 文件名称：annotations.tar.gz、count_tables.tar.gz
- 文件格式：GZ
- 字段映射介绍：压缩归档文件，其中annotations.tar.gz包含基因注释文件（如gene_annotation_v1.1.txt，为基于Mmusculus_v1.1_flatten的基因座短注释表，含制表符分隔字段）；count_tables.tar.gz包含转录组测序计数表相关文件
- 补充文件类
- 文件名称：Supplementary File 1.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：研究相关的补充文件压缩包，具体内容未详细说明
- 表格数据类
- 文件名称：Supplementary File 2.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：Excel格式的补充表格数据，具体字段未详细说明
数据来源
论文“MicroRNAs Shape Circadian Hepatic Gene Expression on a Transcriptome-Wide Scale”（作者Ngoc-Hien Du等，洛桑大学）
适用场景
- 昼夜节律转录组研究: 分析肝脏中miRNAs对节律基因表达相位和振幅的调控作用
- 肝脏miRNA功能研究: 探究miRNAs在肝脏组织特异性时钟驱动基因表达中的适应性功能
- 基因表达调控机制分析: 研究转录后机制（如miRNA介导调控）对mRNA丰度节律的贡献
- 生物医学数据挖掘: 挖掘调控节律转录本的关键miRNAs及易受miRNA调控的节律通路
