数据集概述
本数据集为田鼠（Microtus agrestis）隐存种研究的多基因座分析数据，包含160个个体的7个基因座序列，涉及母系、父系及双亲遗传标记。数据支持欧亚大陆田鼠存在北方、南方及葡萄牙三个遗传谱系的结论，可用于分析谱系分化时间及进化过程，共16个文件。
文件详解
- 文档文件
- 文件名称：README_for_sample_data.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：说明样本数据中“Specimen”列N/A代码的含义，及引用的GenBank登录号来源文献
- 样本数据文件
- 文件名称：sample_data.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含样本编号、物种、谱系、采集地、国家、经纬度及各基因座单倍型、登录号等信息
- 基因单倍型比对文件（共13个）
- 文件名称：DBY7_haplotype_alignment.fas、CYTB_haplotype_alignment.fas、DBX6_haplotype_alignment.fas、RAG1_haplotype_alignment.fas、BRCA1_genotype_alignment.fas、DBX5_haplotype_alignment.fas、DBX6_genotype_alignment.fas、RAG1_genotype_alignment.fas等
- 文件格式：FAS
- 字段映射介绍：各基因座的单倍型序列比对数据
- 基因型比对压缩文件
- 文件名称：CYTB_genotype_alignment.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含CYTB基因的基因型比对数据
适用场景
- 分子生态学研究: 分析田鼠隐存种的遗传多样性及谱系分化
- 进化生物学分析: 研究欧亚大陆田鼠三个谱系的分化时间及形成机制
- 生物地理学研究: 探讨小哺乳动物在欧洲的分布及进化过程
- 遗传标记应用: 验证多基因座标记在隐存种鉴定中的有效性
